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中华临床实验室管理电子杂志

中华临床实验室管理电子杂志 ›› 2019, Vol. 07 ›› Issue (03) : 184 -189. doi: 10.3877/cma.j.issn.2095-5820.2019.03.012

所属专题： 文献；

实验室管理

恶性肿瘤生物样本信息数据库的构建及应用
蒋雪莉1, 李慧2, 柳菁菁3, 张琳娜1, 李文秀1, 姚洁1, 程颖4,†()   
  1. 1. 130012　长春，吉林省肿瘤医院生物样本库
    2. 130012　长春，吉林省肿瘤医院肿瘤转化医学实验室
    3. 130012　长春，吉林省肿瘤医院胸部肿瘤内科
    4. 130012　长春，吉林省肿瘤医院生物样本库；130012　长春，吉林省肿瘤医院肿瘤转化医学实验室；130012　长春，吉林省肿瘤医院胸部肿瘤内科
  • 收稿日期:2018-07-02 出版日期:2019-08-28
  • 通信作者: 程颖
  • 基金资助:
    吉林省科技厅资助项目(20170622005JC); 吉林省科技厅资助项目(20180101008JC); 吉林省卫生厅资助项目(2017J023)

Construction and application of biobank information database for malignant tumors

Xueli Jiang1, Hui Li2, Jingjing Liu3, Linna Zhang1, Wenxiu Li1, Jie Yao1, Ying Cheng4,†()   

  1. 1. Biobank, Jilin Cancer Hospital, Changchun 130012, China
    2. Translational Cancer Research, Jilin Cancer Hospital, Changchun 130012, China
    3. Department of Medical Thoracic Oncology, Jilin Cancer Hospital, Changchun 130012, China
    4. Biobank, Jilin Cancer Hospital, Changchun 130012, China; Translational Cancer Research, Jilin Cancer Hospital, Changchun 130012, China; Department of Medical Thoracic Oncology, Jilin Cancer Hospital, Changchun 130012, China
  • Received:2018-07-02 Published:2019-08-28
  • Corresponding author: Ying Cheng
  • About author:
    Corresponding author: Cheng Ying, Email:
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引用本文：

蒋雪莉, 李慧, 柳菁菁, 张琳娜, 李文秀, 姚洁, 程颖. 恶性肿瘤生物样本信息数据库的构建及应用[J]. 中华临床实验室管理电子杂志, 2019, 07(03): 184-189.

Xueli Jiang, Hui Li, Jingjing Liu, Linna Zhang, Wenxiu Li, Jie Yao, Ying Cheng. Construction and application of biobank information database for malignant tumors[J]. Chinese Journal of Clinical Laboratory Management(Electronic Edition), 2019, 07(03): 184-189.

目的

生物样本库对临床转化性研究具有重要的推动作用，随着生物样品数量的日益增加和研究需求的多样性，传统的电子表格管理模式已不能满足庞大样品量及其临床信息高效、集中管理的需求。因此迫切需要对生物样本实行信息化管理，构建恶性肿瘤生物样本及临床信息的信息化管理体系，以实现生物样本信息的系统化、规范化、高效化管理。

方法

以恶性肿瘤生物样本信息数据库为依托，对恶性肿瘤样品源及样品信息进行结构化设计，通过恶性肿瘤样品组、样品源组、虚拟医用冰箱的构建，整合恶性肿瘤患者基本信息、临床信息等相关信息，并实现查询统计功能。

结果

成功构建了恶性肿瘤生物样本数据库，包含样品组、样品源组、虚拟医用冰箱组，实现了生物样本的查询统计应用，包括各癌种的样品量统计、各科室血液样品和组织样品的采集量统计，以及对样品管出库管理的应用。

结论

构建的恶性肿瘤生物样本信息数据库，数据信息完整、结构设计合理，样品组信息具有可扩展性。该数据库满足了我院当前生物样本数据信息化管理的需求，实现了多项查询统计应用和出库应用，为相关恶性肿瘤疾病的研究提供了可靠保障。

关键词: 恶性肿瘤, 生物样本库, 信息化管理, 数据库
Objective

Biobank plays an important role in translational cancer research. With the rapid increasing number of biosamples and the diversity of research needs, the traditional spreadsheet management model can not satisfy the needs of large sample number and efficient and centralized management of clinical information. Therefore, it is an urgent need to carry out information management of biobank and to build an information management system for biosamples and clinical information of malignant tumors in order to achieve systematic, standardized and efficient management of biosample information.

Methods

Based on malignant tumor biobank information database, the source and sample information are structurally designed. Through the construction of sample group, sample source group and virtual medical refrigerator, the basic and clinical information of patients with malignant tumors is integrated, and the query and statistics function is realized.

Results

The database of malignant tumor biobank has been successfully constructed, including sample group, sample source group and virtual medical refrigerator group. The application of query and statistics of biosamples has been realized, including the statistics of samples of various cancers, blood samples and tissue samples collected from various departments, and the application of sample tube discharge management.

Conclusions

The database of malignant tumor biobank information is constructed, which has completed data information, reasonable structure design and expansibility of sample group information. The database satisfies the current needs of the information management of biosample data in our hospital, realizes a number of query .statistics application and outbound applications, and provides a reliable guarantee for the research of related malignant tumors.

Key words: Malignant tumors, Biobank, Information management system, Database
图1 吉林省肿瘤医院生物样本库数据库的结构
表1 样品的信息构成
样品数据 信息
标准区域信息 病例号、患者姓名、样品容量、样品源、样品组、录入者
自定义区域信息 ?
? 血液样品 ?
? ? 采血时段 ?
? ? ? 化疗 化疗前、化疗两周期后、进展期
? ? ? 手术 术前、术后
? ? ? 放疗 放疗前、放疗中、放疗后
? ? 临床试验 用药前、疗效评价阶段、疾病进展
? ? 取样科室 科室名称
? ? 采血次数 总采血次数、科内采血次数
? ? 离心后状态 正常、凝血、溶血、乳糜血
? ? 抗/促凝剂 EDTA
? ? 存储方式 -80℃
? 组织样品 取材日期、取材时间、取材部位、基线组织、进展组织、入库组织大小、获得病理途径
样品类型 ?
? 血液样品 静脉血浆、静脉血清、静脉白细胞、静脉红细胞
? 组织样品 冻存肿瘤组织、冻存癌旁组织、冻存正常组织、骨髓组织
样品组 肺癌、乳腺癌、甲状腺癌、结肠癌、直肠癌、淋巴瘤、宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢癌、黑色素瘤、膀胱癌、肾癌等
样品位置 冰箱号-层号-架号-列号-盒号-盒内坐标(行/列)
表2 样品源的信息构成
样品源数据 信息内容
标准区域信息 病例号、患者姓名
自定义区域信息 ?
? 基本信息 科室名称、性别、年龄、出生日期、联系电话、病史、家族史、吸烟史
? 临床资料 临床诊断、TNM分期、转移脏器、PS评分、病理诊断、病理诊断日期、手术日期、基因检测日期、基因检测结果、临床试验名称、临床试验用药名称、临床试验用药日期
图2 样本信息的查询统计示例
图3 科室每月血液样品和组织样品的采集量示例
表3 样品出库信息示例
病例号 姓名 样品类型 样品组 样品体积 标本编号 采集日期 离心状态 抗/促凝剂 采血时段 存储方式 位置
10048125 徐** 静脉血浆 肺癌 5 Y267-1 2012.10.29 正常 EDTA 化疗前 -80℃ 冰箱3-层3-架5-列1-盒1(1/A)
10000890 朱** 静脉血浆 肺癌 7.5 Y108-1 2013.01.07 正常 EDTA 临床试验用药前 -80℃ 冰箱1-层1-架2-列2-盒6(1/A)
10026941 唐** 静脉血浆 肺癌 7.5 Y269-2 2014.04.29 正常 EDTA 第一次疗效评价 -80℃ 冰箱1-层1-架3-列4-盒19(1/A)
10027762 张** 静脉血浆 肺癌 7.5 Y276-5 2014.05.29 正常 EDTA 进展期 -80℃ 冰箱1-层1-架3-列4-盒20(1/A)
… ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
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